Xác định và phân tích In Silico họ gen Knox ở cây quýt đường (Citrus Clementina)

Tgp chi Cong nghe Sinh hgc 12(1): 113-123, 2014

XAC DINH VA PHA N TICH INSILICO HO GEN KNOX 0 CAY QUYT DlTOfNG {CITRUS

CLEMENTINA)

Cao Phi Bang', Christophe Dunand^

' Truang Dgi hoc Hiing Vuong

^ Laboratoire de Recherche en Sciences Vegetales, Universite de Toulouse, UPS, UMR 5546, BP 42617, F￾31326, Castanet-Tolosan, France

^ CNRS UMR 5546. BP 42617, F-3I326, Castanet-Tolosan, France

Ngiy nhan bai: 21.01.2014

Ngaynhandang: 15.3.2014

T 6 M TAT

Cac gen KNOXmS. hoa cac tac nhan di€u hoa phiSn ma homeodoniain, cac tac nhan nay dong vai tro quan

frong trong viec duy tri hoat tinh cua mo phan smh dinh 6 thuc vat Dong thdi cac protein nay cung co vai tro

trong su phat sinh hinh thai va sir phat tn£n thii cip a nhieu loai ciy xanh. Trong cong trinh nay, chung toi sir

dung cac phucmg phap nghien cihi in silico de xac dinh va phan tich cac gen KNOX a trong he gen ciia cay

quyt dudng (Citrus Clementina), loai cay co gia trj ldn trong ho Cam. Tong so 10 gen KNOXda dugc xac dinh

cr cay quyt duong nhd cac phan tich tren toan bo he gen Tat ca cac gen nay deu co chira hai viing bao thu

KNOXl (PF03790) va KN0X2 (PF03791), nhung chi 9 trong t6ng s6 10 gen co chila viing bao diii ELK

(PF03789) vi Homeodomain (Homeobox^KN, PF05920) Cac gen KNOX ma hoa khong lien mc, chua tir hai

tcri nam infron. Cac gen CclKNOXphan bo tren 5 trong tong so 9 nhiem sac the ciia cay quyl duong Chi c6 hai

gen CclKNOXI-I va CciKNOXl-2 dugc hinh thanh nho su kien lap doan cua nhiem sac the. Cac gen

CclKNOX CO the dugc phan chia thanh ba phan nhom la phan nhom KNOX I, ph^n nhom KNOX II va phan

nhom KNOXM voi lan lugt 6, 3 va 1 thanh vign trong cAc phan nhom nay. K§t qua phan tich in silico viing

promoter cua cac gen cho thay chiing co the it chiu su dieu hoa cua cac tac nhan vo sinh cCia mfii tnrong nhimg

c6 the chiu sir dilu hoa cua mpt so phytohormon nhir auxm, gibberellin va dac biet la cac hpp chat

brassinosteroit. Sau trong tong so 10 gen CclKNOX b\eu hi^n frong cac co quan co chua mo phan sinh dinh,

trong do cac gen KNOXphan nhom II bieu hien manh nhat,

Tu khda: bieu hien gen, cdu trdc exonhntron, cay di truyen, he gen. in silico, KNOX, mo phan .•unh dinh.

promoter, quyt du&ng

MCJ DAU ciia cay, Trong qua trinh sinh truong scr cap, cac lap

vo va the ciia mo phan sinh dinh choi san sinh ra cac

Cay quyt ducmg (Citrus clementina) la mot thu tign biSu bi va tign tucmg tkng, khi cac lop l6 bao nay

frong nh6m quyt, thuoc ho Cam, mot frong nhimg hp keo dai va biet hoa se sinh ra vo va cac mo dSn (Evert,

cay 5n qua quan frpng nhai Iren the giai. Theo thong 2006).

ke ciia Fao, nam 2004, san luong ciia cac cay trong ^^ ^ (KNotted-like homeobOX) la ten goi tat

hp nay dat 108,535 ti tan, frong do 22% thuoc ve cac , . , , ,

gi6ng qu;^ (Khan, 2007). Cl Viet Nam, th6ng ke cho ^^^ ^^^ P™'^'" ^'^ ^.^"^ ™"g ^ao thu homeodomam

thdy san lupng hang nam ciia cac cay thupc ho cam, co kha nang hen ket vai ADN, cac protem nay co

quyt dat fren duai 700 nghin t^n (Th6ng ke Viet ck\x friic giSng vai protein dupc ma hoa boi gen

Nam 2012). Vai gia tri cao, cay quyt ducmg la mot knoitedl ditac phal hien lan dau each day khoang hai

trong cac cay dugc lira chpn lam dai dien trong du an muai nam a cay ngo (Vollbrecht et al, 1991), Cac

giai frinh tu he gen cac cay Ihupc hp Cam (Aleza el ^^^ ^ g ^^^ ^^^ j^^ , ^^^ p^jgn ^na nay dong vai fro

'• quan trong frong sir phat trien choi cay (Groover et

al, 2006; Du el al, 2009). Su phat hien cac gen

KNOX cung cap nhung hieu biet o mirc phan frr ve

Mo phdn sinh dinh ch6i la mot tap hpp cac Ie bao

nam 6 chop sinh tnrong ciia cac canh cay, dam bao

qui trinh phat sinh phoi lien tuc frong su6t cupc doi viec duy Iri chuc nang ciia mo phan sinh dinh choi.

113