Scientific report:

J. Sci. Dev. 2009, 7 (Eng.Iss.1): 22 - 29 HA NOI UNIVERSITY OF AGRICULTURE

22

Genetic Variation of Wakegi Onion (Alllium  wakegi

Araki) in Vietnam

Đa dạng di truyền các mẫu giống hành wakegi thu thập từ Việt Nam

Pham Thi Minh Phuong1

, Shiro Isshiki2

and Yosuke Tashiro2

1Department of Vegetables, Fruits, Flowers and Ornamental plants,

Faculty of Agronomy, Hanoi University of Agriculture, Gialam, Hanoi, Vietnam

2Faculty of Agriculture, Saga University, Saga city, Japan

TÓM TẮT

Để đánh giá nguồn gen các mẫu giống hành wakegi (Alllium × wakegi Araki) trong việc lai tạo các

cây họ hành thì đa dạng di truyền trong và giữa các mẫu giống hành wakegi thu thập từ miền Bắc,

Trung và Nam của Việt Nam và hành hoa, hành củ thu thập từ Nhật, Thái Lan đã được nghiên cứu dựa

trên các đặc điểm hình thái, sinh lý và tính đa hình DNA của nhân, tế bào chất và ti thể. Kết quả

nghiên cứu tế bào và phân tích GISH chứng tỏ tất cả các mẫu giống hành wakegi từ Việt Nam là con

lai giữa hành hoa và hành củ và có tế bào chất được nhận từ hành hoa. Chúng có 8 nhiễm sắc thể

nhận từ hành hoa và 8 nhiễm sắc thể nhận từ hành củ. Kết quả phân tích RAPD cho thấy 16 trong số

40 mồi sử dụng đã tạo ra 160 đoạn DNA trong tất cả các mẫu giống, trong đó có 135 đoạn đa hình.

Trên cây di truyền được xây dựng từ kết quả của phân tích RAPD, sự đa dạng di truyền được thấy

giữa các mẫu giống hành wakegi. Một số nhóm phụ được hình thành tuy nhiên các mẫu giống được

thu từ một địa điểm không cùng vào một nhóm. Các phân tích RAPD khác loài đã thu được 145 đoạn

DNA. Trong số các đoạn DNA thu được từ các mẫu giống hành wakegi thì 85 đoạn giống hành hoa và

71 đoạn giống hành củ. Trên cây di truyền 3 nhóm này được tách biệt rõ ràng lần lượt là nhóm các

mẫu giống hành wakegi, nhóm các mẫu giống hành củ và nhóm mẫu giống hành hoa. Khoảng cách di

truyền trên cây di truyên giữa hành wakegi và hành củ là 0.3 và giữa hành wakegi và hành lá là 0.5.

Key words: Alllium × wakegi Araki, đa dạng di truyền, DNA tế bào chất, DNA ti thể, hành wakegi,

RAPD.

SUMMARY

To evaluate wakegi onion (Alllium × wakegi Araki) strains as genetic resource for breeding of

onions in Vietnam, genetic variation among and between wakegi onions collected from the North,

Central and South regions in Vietnam and Japanese bunching onion, added shallot strains from

Japan, Thailand were studied basing on morphological, physiological characters and polymorphisms

of nuclear, chloroplast and mitochondrial DNAs. The results from cytological and genomic in situ

hybridization (GISH) analyses demonstrated that all the examined wakegi onion strains from Vietnam

were hybrid between Japanese bunching onion and shallot with the cytoplasm from Japanese

bunching onion and possessed eight chromosomes from shallot and eight chromosomes from

Japanese bunching onion in the somatic root tip cells. The intraspecific analysis among wakegi onion

showed that 16 out of 40 primers used in RAPD analysis produced total 160 distinct bands in all the

strains examined and 135 bands were polymorphic. In the dendrogram of RAPD data, variation was

detected between wakegi onion strains. There were many sub- groups however all the strains from the

same region were not always formed into one sub-group. The interspecific analysis produced total

145 DNA bands and among wakegi onion band patterns detected, 58 bands were similar to those

obtained from Japanese bunching onion, 71 bands similar to those from shallot. Three distinct groups

were found as shallot group, wakegi onion group and Japanese bunching onion group. The genetic

distance value between wakegi onion and shallot in phylogenetic tree was 0.3, and that between

wakegi onion and Japanese bunching onion was 0.5.