Nghiên cứu sự tiến hóa của gene chlI trong plastome ở nhóm tảo Cryptomonas (Cryptophyta)

218

NGHIÊN CỨU SỰ TIẾN HÓA CỦA GENE chlI TRONG PLASTOME Ở

NHÓM TẢO CRYPTOMONAS (CRYPTOPHYTA)

Trần Hoàng Dũng2,2,3, Đặng Thị Quế Chi4

, Nguyễn Thị Ngọc Linh4

,

Nguyễn Thị Tú Anh4

, Phan Quốc Tâm2

1 Khoa Khoa học Nông nghiệp – Công nghệ Sinh học, trường Cao đẳng Nguyễn Tất Thành, Tp HCM, VN

2 Viện Công nghệ cao NTT, trường Cao đẳng Nguyễn Tất Thành, Tp HCM, VN

3 Phòng Sinh học Phân tử, Viện Công nghệ Sinh học – Thực phẩm, trường Đại học Công nghiệp, Tp HCM,VN

4

Lớp DHSH3, Viện Công nghệ Sinh học – Thực phẩm, trường Đại học Công nghiệp, Tp HCM,VN

TÓM TẮT

Cryptomonas là nhóm tảo đơn bào sống tự dưỡng. Tuy nhiên một phát hiện gần đây

cho thấy ít nhất 3 dòng tảo Cryptomonas đã thay đổi chế độ sống từ tự dưỡng sang dị dưỡng

bắt buộc. Điều này gợi lên nhiều câu hỏi lý thú về sự tiến hoá của dòng tảo dị dưỡng

Cryptomonas khi so với chị em tự dưỡng lân cận. Tiếp nối với những nghiên cứu trước đó,

nghiên cứu này sử dụng gene chlI, một gene tham gia vào quá trình tổng hợp chlorophyl, để

dò tìm bằng chứng tiến hoá của plastome của dòng tảo Cryptomonas dị dưỡng và quang

dưỡng. Mười chín chủng tảo Cryptophyta được chọn để đọc trình tự gene chlI. Kết quả phân

tích tần suất base, giá trị đồng nhất, vùng bảo tồn chức năng, và cây tiến hoá đã cho thấy

gene chlI đã tăng tốc tiến hoá rất mạnh ở cả hai mức protein và nucleotide ở các chủng

Cryptomonas dị dưỡng.

ABSRACT

Cryptomonas is a small group of phototrophic flagellate. A newly founding showed

that at least three different lineage Cryptomonas changed their life-style to heterotrophic.

This phenomenon reveals many interest questions about evolutionary history of heterotrophic

Cryptomonas in comparison with their sisters. Continuing with previous projects, we

employed chlI gene (a gene participate in the chlorophyll synthetic pathway) as a potential

marker for finding evolutionary evidences of plastomes in both autotrophic and heterotrophic

Cryptomonas. Nine-tenth Cryptophyta strains were used for reading their chlI nucleotide

composition. Throughout the analyzing of base composition, identity value, conversed

functional domains as well as phylogenetic reconstruction, we conclude that chlI gene in

heterotrophic Cryptomonas seem to have a accelerated evolutionary rate in than their sister.

Từ khoá: Cryptomonas, gene chlI, tiến hoá phân tử

2 TS Trần Hoàng Dũng công tác tại Phòng Sinh học Phân tử, Viện Công nghệ Sinh học – Thực phẩm, trường Đại

học Công nghiệp đến 04/2011 thì chuyển về Khoa Khoa học Nông nghiệp – Công nghệ Sinh học, trường Cao

đẳng Nguyễn Tất Thành, Tp HCM, VN. Liên lạc [email protected], ĐT 01222999537