Thư viện tri thức trực tuyến
Kho tài liệu với 50,000+ tài liệu học thuật
© 2023 Siêu thị PDF - Kho tài liệu học thuật hàng đầu Việt Nam

Tạo dòng và xác định trình tự đoạn gen mã hóa protein RHO liên quan đến cơ chế thực bào ở tôm sú (Penaeus monodon)
Nội dung xem thử
Mô tả chi tiết
Hoàng Thị Thu Yến và Đtg Tạp chí KHOA HỌC & CÔNG NGHỆ 96(08): 145 - 150
145
TẠO DÒNG VÀ XÁC ĐỊNH TRÌNH TỰ ĐOẠN GEN MÃ HÓA PROTEIN RHO
LIÊN QUAN ĐẾN CƠ CHẾ THỰC BÀO Ở TÔM SÚ (PENAEUS MONODON)
Hoàng Thị Thu Yến
1*, Kim Thị Phương Oanh2
, Nông Văn Hải
2
1
Trường Đại học Khoa học - ĐH Thái nguyên
2 Viện Công nghệ sinh học, Viện Khoa học và Công nghệ Việt Nam
TÓM TẮT
Protein Rho là một thành viên thuộc siêu họ Ras, protein này thực hiện chức năng liên quan đến cơ
chế thực bào, một cơ chế miễn dịch chính ở tôm. Trong nghiên cứu này, chúng tôi lần đầu tiên tiến
hành phân lập đoạn gen Rho từ mẫu mô gan tôm sú bị bệnh đốm trắng. Để khuếch đại một phần
đoạn gen Rho bằng kỹ thuật RT - PCR, cặp mồi suy diễn được thiết kế dựa trên trình tự amino
acid bảo thủ của protein Rho ở một số loài đã biết. Sau đó, sản phẩm RT-PCR được tạo dòng trong
vector pCR2.1 và tiến hành xác định trình tự. Trình tự đoạn gen Rho thu được có kích thước 272
bp, mã hóa 90 amino acid. Trình tự nucleotide đoạn gen Rho được đăng ký trên Genbank với mã
số JN617867. Kết quả nghiên cứu của chúng tôi góp phần tạo nguyên liệu nghiên cứu cấu trúc gen
Rho hoàn chỉnh, từ đó phục vụ nghiên cứu chức năng của protein Rho.
Từ khóa: Tôm sú, protein Rho, thực bào, gen liên quan đến miễn dịch, protein siêu họ Ras
MỞ ĐẦU
*
Thực bào là cơ chế miễn dịch tế bào chính ở
tôm, liên quan đến sự thu nhận các vật thể lạ
từ bên ngoài. Cơ chế này được thực hiện bởi
bạch cầu bán hạt và bạch cầu hạt. Quá trình
thực bào bao gồm các bước: hướng hóa, bám
chặt, tiêu hóa, phá hủy tác nhân gây bệnh và
xuất bào [5], [10]. Quá trình thực bào ở động
vật không xương sống nói chung và tôm nói
riêng tương tự như ở động vật có xương sống.
Tuy nhiên, sự tiếp xúc miễn dịch luôn được
thực hiện có tính ngẫu nhiên, rất hiếm chủ
động theo kiểu hóa hướng động ở động vật có
xương sống [1]. Ngoài ra, bạch cầu bán hạt có
khả năng nhận biết các tác nhân xâm nhập và
hoạt động như là một sự opsonins hóa kết hợp
với hệ thống hoạt hóa proPO [8].
Protein Rho là một thành viên thuộc siêu họ
Ras (Ras superfamily). Hầu hết các nghiên
cứu của các protein Ras về hoạt tính miễn
dịch tập trung vào sự điều khiển cơ chế thực
bào bởi Rho GTPase [4] và các nhân tố chịu
tác động của Rho ảnh hưởng đến sự điều
chỉnh vận động của actin trong quá trình thực
bào ở động vật có vú [3]. Ở tôm thẻ Nhật Bản
(Marsupenaeus japonicus), nghiên cứu so
sánh sự biểu hiện gen giữa tôm kháng virus
WSSV với tôm thường cho thấy: các gen
*
Tel: 0912 896298, Email: [email protected]
Ran, Rho và Rab biểu hiện tăng đáng kể ở
tôm kháng virus. Đây là bằng chứng chứng tỏ
những GTPase này tham gia vào quá trình
truyền tín hiệu trong phản ứng bảo vệ ở tôm
[6]. Ngoài ra, khi xây dựng thư viện EST tôm
sú Tassanakajon và đtg (2006) đã chỉ ra: khi
tôm sú ở trong điều kiện stress nhiệt độ (heat
stress), gen Rho ở mô máu của tôm sú được
biểu hiện tăng [9]. Đến nay, gen Rho từ tôm
sú (Penaeus monodon) vẫn chưa được phân
lập. Do đó, để góp phần nghiên cứu cấu trúc
và chức năng của protein này, bước đầu
chúng tôi tiến hành tạo dòng và xác định trình
tự một phần đoạn gen Rho (gọi tắt là đoạn
gen Rho) từ mẫu tôm sú Việt Nam.
NGUYÊN LIỆU VÀ PHƯƠNG PHÁP
Nguyên liệu
Chúng tôi đã tiến hành thu thập mẫu tôm bị
bệnh đốm trắng tại Trạm Nghiên cứu thủy sản
nước lợ, km10 đường cao tốc Hải Phòng - Đồ
Sơn và các đầm nuôi tư nhân vùng lân cận.
Ngay sau khi nhận tôm nguyên con, mô gan
đã được tách riêng và bảo quản trong dung
dịch nitơ lỏng.
Phương pháp
Tách chiết RNA tổng số, tinh sạch mRNA và
tổng hợp cDNA
Phương pháp tách chiết RNA tổng số, tinh
sạch mRNA và tổng hợp cDNA cho phản ứng