Phân lập vi khuẩn Nitrate hóa thu tại vùng biển đảo Hải Phòng - Quảng Ninh

ĐẠI HỌC THÁI NGUYÊN

TRƯỜNG ĐẠI HỌC SƯ PHẠM

Phonephet KONGMANY

PHÂN LẬP VI KHUẨN

NITRATE HÓA THU TẠI VÙNG BIỂN ĐẢO

HẢI PHÒNG - QUẢNG NINH

LUẬN VĂN THẠC SĨ SINH HỌC

THÁI NGUYÊN, NĂM 2020

ĐẠI HỌC THÁI NGUYÊN

TRƯỜNG ĐẠI HỌC SƯ PHẠM

Phonephet KONGMANY

PHÂN LẬP VI KHUẨN

NITRATE HÓA THU TẠI VÙNG BIỂN ĐẢO

HẢI PHÒNG - QUẢNG NINH

Ngành: Di truyền học

Mã số: 8.42.01.21

LUẬN VĂN THẠC SĨ SINH HỌC

Người hướng dẫn khoa học: 1. TS. Đỗ Mạnh Hào

2. TS. Hoàng Phú Hiệp

THÁI NGUYÊN, NĂM 2020

i

LỜI CAM ĐOAN

Tôi xin cam đoan đây là công trình nghiên cứu của riêng cá nhân tôi. Các số

liệu, kết quả nghiên cứu trong luận văn là trung thực và chưa được ai công bố trong bất

kỳ công trình nào khác. Nếu sai tôi xin hoàn toàn chịu trách nhiệm.

Tác giả

Phonephet KONGMANY

ii

LỜI CẢM ƠN

Lời đầu tiên, tôi xin được bày tỏ lòng kính trọng và biết ơn sâu sắc đến

TS. Đỗ Mạnh Hào - Trạm nghiên cứu biển Đồ Sơn, Viện Tài Nguyên và Môi

Trường Biển, TS. Hoàng Phú Hiệp- Khoa Sinh học, Trường Đại học Sư phạm

Thái Nguyên, là những người thầy đã tận tình hướng dẫn, chỉ bảo giúp đỡ cho

tôi những kiến thức, những kinh nghiệm, lời khuyên quý báu, tạo mọi điều kiện

thuận lợi cho tôi trong quá trình triển khai, thực hiện và hoàn thành luận văn.

Tôi xin chân thành cảm ơn cùng các kỹ thuật viên của Trạm nghiên cứu

biển Đồ Sơn đã nhiệt tình chỉ bảo, giúp đỡ tôi rất nhiều trong suốt thời gian thực

tập.

Cuối cùng, tôi xin được gửi lời cảm ơn đến gia đình, bạn bè, tập thể lớp

Cao học K26 và các thầy cô Khoa Sinh học, Trường Đại học Sư phạm Thái

Nguyên những người đã luôn sẵn sàng giúp đỡ và động viên tinh thần cho tôi

trong quá trình học tập và thực hiện đề tài.

Thái Nguyên, ngày 22 tháng 09 năm 2020

Học viên

Phonephet KONGMANY

iii

MỤC LỤC

LỜI CAM ĐOAN ...................................................................................................i

LỜI CẢM ƠN .......................................................................................................ii

MỤC LỤC............................................................................................................iii

DANH MỤC CHỮ VIẾT TẮT...............................................................................v

DANH MỤC BẢNG.............................................................................................vi

DANH MỤC HÌNH.............................................................................................vii

MỞ ĐẦU..............................................................................................................1

1. Lý do chọn đề tài .............................................................................................1

2. Mục tiêu nghiên cứu ........................................................................................2

3. Nội dung nghiên cứu .......................................................................................2

Chương 1: TỔNG QUAN TÀI LIỆU...................................................................3

1.1. Quá trình nitrate hóa trong chu trình nitơ.....................................................3

1.2. Nhóm vi khuẩn nitrate hóa ...........................................................................8

1.2.1. Đặc điểm chung .........................................................................................8

1.2.2. Vi khuẩn oxy hóa ammonia.......................................................................9

1.2.3. Vi khuẩn oxy hóa nitrite ............................................................................9

1.3. Chu trình Nitơ trong đầm nuôi thủy sản và ứng dụng của nhóm vi khuẩn

nitrate hóa trong nuôi trồng thủy sản ......................................................10

1.3.1 Chu trình Nitơ trong đầm nuôi thủy sản...................................................10

1.3.2. Ứng dụng của nhóm vi khuẩn nitrate hóa trong nuôi trồng thủy sản......12

1.4. Tình hình nghiên cứu nhóm vi khuẩn nitrate hóa trên thế giới và Việt Nam .......14

1.4.1. Tình hình nghiên cứu nước ngoài............................................................14

1.4.2. Đánh giá tổng quan tình hình nghiên cứu trong nước.............................16

Chương 2: VẬT LIỆU NGHIÊN CỨU VÀ PHƯƠNG PHÁP NGHIÊN CỨU ....20

2.1. Vật liệu, thiết bị, hóa chất, địa điểm, thời gian nghiên cứu........................20

2.2. Phương pháp nghiên cứu ............................................................................22

2.2.1. Phương pháp thu mẫu và bảo quản mẫu..................................................22

iv

2.2.2. Phương pháp phân tích thông số thủy lí..................................................23

2.3.3. Phương pháp phân tích thông số thủy hóa ..............................................23

2.3.4. Phương pháp phân tích, xác định mật độ vi khuẩn tổng số và vi khuẩn

nitrate hóa ................................................................................................24

2.3.5. Phương pháp phân lập, làm giàu và thuần khiết các chủng vi khuẩn

nitrate hóa ................................................................................................25

2.3.6. Phương pháp xác định hình thái tế bào, nhuộm Gram tế bào vi khuẩn ..26

2.3.7. Định danh các chủng vi khuẩn nitrate hóa bằng gen 16S rRNA ............27

2.3.8. Phương pháp xử lý số liệu.......................................................................28

Chương 3: KẾT QUẢ VÀ THẢO LUẬN...........................................................29

3.1. Kết quả quan trắc các yếu tố môi trường khu vực nghiên cứu...................29

3.1.1. Kết quả các thông số thủy lí ....................................................................29

3.1.2. Kết quả các thông số thủy hóa.................................................................30

3.1.3. Kết quả vi sinh vật...................................................................................32

3.2. Kết quả phân lập và thuần khiết các chủng vi khuẩn nitrate...............................33

3.2.1. Nhân giống cấp 1.....................................................................................33

3.2.2. Nhân giống cấp 2.....................................................................................35

3.3. Phân lập, tuyển chọn các chủng vi khuẩn nitrate hóa ................................36

3.3.1. Phân lập các chủng vi khuẩn nitrate hóa .................................................36

3.3.2. Định danh các chủng vi khuẩn nitrate hóa ..............................................39

KẾT LUẬN VÀ KIẾN NGHỊ ............................................................................45

TÀI LIỆU THAM KHẢO..................................................................................46

PHỤ LỤC...............................................................................................................