Nghiên Cứu Đa Dạng Di Truyền Nguồn Gen Giống Na Dai Võ Nhai Thái Nguyên Bằng Chỉ Thị Phân Tử Rapd

i

TRƢỜNG ĐẠI HỌC LÂM NGHIỆP

VIỆN CÔNG NGHỆ SINH HỌC LÂM NGHIỆP

-------------------------

KHÓA LUẬN TỐT NGHIỆP

NGHIÊN CỨU ĐA DẠNG DI TRUYỀN NGUỒN GEN GIỐNG NA DAI

VÕ NHAI - THÁI NGUYÊN BẰNG CHỈ THỊ PHÂN TỬ RAPD

NGÀNH : CÔNG NGHỆ SINH HỌC

MÃ SỐ : 7420201

Giáo viên hướng dẫn : PGS. TS. Bùi Văn Thắng

: ThS. Nguyễn Thị Huyền

Sinh viên thực hiện : Lô Đức Tôn

Mã sinh viên : 1453071848

Lớp : K59B - CNSH

Khóa học : 2014 - 2018

Hà Nội, 2018

ii

LỜI CẢM ƠN

Đề tài khóa luận tốt nghiệp “Nghiên cứu đa dạng di truyền nguồn gen

giống Na dai Võ Nhai - Thái Nguyên bằng chỉ thị phân tử RAPD” của tôi đƣợc

hoàn thành tại Trƣờng Đại học Lâm nghiệp – Hà Nội

Để hoàn thành đề tài nghiên cứu, trƣớc hết tôi xin bày tỏ lòng biết ơn sâu

sắc đến PGS.TS. Bùi Văn Thắng Viện trƣởng Viện Công nghệ Sinh học và ThS.

Nguyễn Thị Huyền là ngƣời đã tạo điều kiện, hƣớng dẫn tôi từ những bƣớc đầu

tiên cần có, những bƣớc tiếp cận đầu tiên trong nghiên cứu đề tài, tận tâm và

nhiệt tình, giúp tôi có thể hình thành nên các kỹ năng cần thiết trong suốt thời

gian làm khóa luận tốt nghiệp.

Tôi xin đƣợc trân trọng cảm ơn toàn thể thầy cô giáo trong Viện Công

nghệ Sinh học, Phòng Đào tạo, Trƣờng Đại học Lâm Nghiệp đã quan tâm, giúp

đỡ, tạo điều kiện thuận lợi cho tôi thực hiện đề tài.

Tôi cũng xin bày tỏ lòng biết ơn tới bạn bè cùng gia đình đã tận tình động

viên, giúp đỡ trong suốt thời gian thực hiện khóa luận.

Do quá trình thực hiện đề tài còn có nhiều hạn chế về mặt thời gian, kinh

nghiệm. Đề tài không tránh khỏi những thiếu sót. Rất mong nhận đƣợc sự đóng

góp ý kiến của các thầy cô, bạn bè để đề tài đƣợc hoàn thiện hơn.

Tôi xin chân thành cảm ơn!

Sinh viên thực hiện

Lô Đức Tôn

iii

MỤC LỤC

LỜI CẢM ƠN ........................................................................................................i

MỤC LỤC............................................................................................................iii

DANH MỤC CHỮ VIẾT TẮT............................................................................. v

DANH MỤC BẢNG............................................................................................ vi

DANH MỤC HÌNH ............................................................................................vii

ĐẶT VẤN ĐỀ....................................................................................................... 1

Chƣơng 1. TỔNG QUAN TÀI LIỆU ................................................................... 3

1.1. Giới thiệu chung về cây Na dai (Annona squamosa L.)............................... 3

1.1.1. Đặc điểm sinh học của cây Na .................................................................... 3

1.1.2. Đặc điểm hình thái của cây na .................................................................... 5

1.1.3. Giá trị dinh dƣỡng của cây Na dai .............................................................. 7

1.1.4. Giá trị dƣợc liệu .......................................................................................... 9

1.1.5. Giá trị kinh tế, xã hội và môi trƣờng sinh thái.......................................... 11

1.2. Một số phƣơng pháp phân tích đa dạng di truyền........................................ 13

1.2.1. Kỹ thuật RAPD ........................................................................................ 13

1.2.2. Kỹ thuật RFLP .......................................................................................... 14

1.2.3. Các chỉ thị dựa trên cơ sở PCR................................................................. 15

1.3. Một số ứng dụng kĩ thuật RAPD trong phân tích đa dạng di truyền ........... 15

1.3.1. Một số ứng dụng kĩ thuật RAPD trong phân tich đa dạng di truyền trên thế

giới ................................................................................................................... 15

1.3.2. Một số ứng dụng kĩ thuật RAPD trong phân tich đa dạng di truyền ở Việt

Nam ................................................................................................................... 17

Chƣơng 2. MỤC TI U - V T LIỆU - N I DUNG V PHƢƠNG PH P

NGHI N CỨU.................................................................................................... 19

2.1. Mục tiêu nghiên cứu..................................................................................... 19

2.2. Nội dung nghiên cứu.................................................................................... 19

2.3. Vật liệu và địa điểm nghiên cứu .................................................................. 19

iv

2.3.1. Vật liệu nghiên cứu ................................................................................... 19

2.3.2. Địa điểm nghiên cứu ................................................................................. 20

2.4. Hóa chất và các thiết bị sử dụng trong nghiên cứu...................................... 21

2.4.1Hóa chất....................................................................................................... 21

2.4.2. Thiết bị, máy móc sử dụng trong nghiên cứu ........................................... 22

2.5. Phƣơng pháp nghiên cứu.............................................................................. 23

2.5.1. Phƣơng pháp tách chiết DNA tổng số ...................................................... 23

2.5.2. Phƣơng pháp PCR với mồi ngẫu nhiên..................................................... 24

2.5.3. Phƣơng pháp điện di.................................................................................. 25

2.5.4. Xây dựng giản đồ phả hệ DNA................................................................. 26

Chƣơng 3. KẾT QUẢ VÀ THẢO LU N .......................................................... 27

3.1. Kết quả tách chiết DNA tổng số từ 17 mẫu Na Dai..................................... 27

3.2. Kết quả phân tích đa hình các phân đoạn DNA........................................... 27

3.3. Mối tƣơng quan di truyền của 17 mẫu Na dai nghiên cứu........................... 34

KẾT LU N VÀ KIẾN NGHỊ............................................................................. 39

TÀI LIỆU THAM KHẢO

v

DANH MỤC CHỮ VIẾT TẮT

Từ viết tắt Viết đầy đủ

CTAB Cetyl Trimethyl Ammonium Bromide

DNA Deoxyribonucleic acid

EDTA Ethylenediaminetetraacetic acid

PCR Polymerase Chain Reaction

RAPD Random Amplyfied Polymorphism ADN

RFLP Restriction Fragment Length Polymorphism

TAE Tris - Acetic acid – EDTA

AFLP Amplified Fragments Length Polymorphism

DAF DNA Amplification Fingerprinting

NST Nhiễm sắc thể