Thư viện tri thức trực tuyến
Kho tài liệu với 50,000+ tài liệu học thuật
© 2023 Siêu thị PDF - Kho tài liệu học thuật hàng đầu Việt Nam

Xây dựng mô hình định lượng 3D-QSAR dựa trên dữ liệu chống oxy hóa tương đương trolox (TEAC) và ứng dụng để thiết kế peptide chống oxy hóa : Khóa luận tốt nghiệp Khoa Công nghệ Hóa học - Chuyên ngành: Công nghệ Hóa Hữu cơ
Nội dung xem thử
Mô tả chi tiết
TRƯỜNG ĐẠI HỌC CÔNG NGHIỆP TP.HCM
KHOA CÔNG NGHỆ HÓA HỌC
KHÓA LUẬN TỐT NGHIỆP
XÂY DỰNG MÔ HÌNH ĐỊNH LƯỢNG 3DQSAR DỰA TRÊN DỮ LIỆU CHỐNG OXY
HÓA TƯƠNG ĐƯƠNG TROLOX (TEAC)
VÀ ỨNG DỤNG ĐỂ THIẾT KẾ PEPTIDE
CHỐNG OXY HÓA
Giảng viên hướng dẫn: TS. TRẦN THỊ THANH NHÃ
Sinh viên thực hiện: NGUYỄN THỊ MINH ANH
MSSV: 18019881
Lớp: DHHC14A
Khoá: 2018 – 2022
Tp. Hồ Chí Minh, tháng 7 năm 2022
TRƯỜNG ĐẠI HỌC CÔNG NGHIỆP TP.HCM
KHOA CÔNG NGHỆ HÓA HỌC
KHÓA LUẬN TỐT NGHIỆP
XÂY DỰNG MÔ HÌNH ĐỊNH LƯỢNG 3DQSAR DỰA TRÊN DỮ LIỆU CHỐNG OXY
HÓA TƯƠNG ĐƯƠNG TROLOX (TEAC)
VÀ ỨNG DỤNG ĐỂ THIẾT KẾ PEPTIDE
CHỐNG OXY HÓA
Giảng viên hướng dẫn: TS. TRẦN THỊ THANH NHÃ
Sinh viên thực hiện: NGUYỄN THỊ MINH ANH
MSSV: 18019881
Lớp: DHHC14A
Khoá: 2018 – 2022
Tp. Hồ Chí Minh, tháng 7 năm 2022
TRƯỜNG ĐH CÔNG NGHIỆP TP. HCM
KHOA CÔNG NGHỆ HÓA HỌC
----- // -----
CỘNG HOÀ XÃ HỘI CHỦ NGHĨA VIỆT NAM
Độc lập – Tự do - Hạnh phúc
----- // -----
NHIỆM VỤ KHÓA LUẬN TỐT NGHIỆP
Họ và tên sinh viên: Nguyễn Thị Minh Anh
MSSV: 18019881
Chuyên ngành: Công nghệ Hóa Hữu Cơ
Lớp: DHHC14A
1. Tên đề tài khóa luận/đồ án: Xây dựng mô hình định lượng 3D-QSAR dựa trên dữ liệu
chống oxy hóa tương đương trolox (TEAC) và ứng dụng để thiết kế peptide chống oxy
hóa
2. Nhiệm vụ:
- Thu thập dữ liệu peptide chống oxy hóa TEAC;
- Tối ưu hóa cấu trúc của các peptide trong data sử dụng phương pháp Semi Emperical
PM7;
- Thực hiện tính toán các mô tả phân tử sử dụng phần mềm Maestro;
- Xây dựng mô hình mối quan hệ định lượng cấu trúc – hoạt tính chống oxy hóa
(QSAR) với các thông số thống kê tin cậy;
- Sử dụng mô hình để dự đoán hoạt tính chống oxy hóa của peptide mới và thiết kế
peptide có hoạt tính oxy hóa cao;
- Thực hiện phân tích thực nghiệm bắt gốc;
- So sánh kết quả thực nghiệm và mô hình để đánh giá hiệu quả của quy trình phân
tích.
3. Ngày giao khóa luận tốt nghiệp: 22/10/2021
4. Ngày hoàn thành khóa luận tốt nghiệp: 08/07/2022
5. Họ tên giảng viên hướng dẫn: TS. Trần Thị Thanh Nhã
Tp. Hồ Chí Minh, ngày 08 tháng 07 năm 2022
Chủ nhiệm bộ môn Giảng viên hướng dẫn
chuyên ngành
LỜI CÁM ƠN
Trải qua 4 năm học tập và gắn bó tại trường Đại học Công nghiệp Thành phố Hồ Chí
Minh chắc hẳn sẽ để lại trong kí ức mỗi sinh viên rất nhiều kỉ niệm, không chỉ đơn giản là
tình bạn, tình thầy trò mà còn là cả bầu trời tri thức làm hành trang chắp cánh cho những ước
mơ bay xa, bay cao hơn nữa. Giảng đường Đại học có lẽ là nơi bắt nguồn cho những ước
mơ thành hiện thực, còn hiện thực được vẽ theo cách nào và vẽ như thế nào là nhiệm vụ của
mỗi sinh viên. Đề tài tốt nghiệp mà em thực hiện lần này được coi như thành quả cho sự nỗ
lực và cố gắng của bản thân em đồng thời là cột mốc đánh dấu việc hoàn thành chương trình
Đại học, đánh giá toàn bộ quá trình học tập và năng lực tư duy nghiên cứu của sinh viên.
Em xin gửi lời tri ân chân thành đến Ban lãnh đạo và Ban Giám hiệu nhà trường đã
luôn quan tâm đến điều kiện cơ sở vật chất, môi trường học tập để em được an tâm học tập.
Chính vì thế bản thân em luôn cảm thấy tự hào trước quyết định của mình khi chọn Đại học
Công nghiệp là nơi để chinh phục những đỉnh cao tri thức mới. Bên cạnh đó em cũng không
quên gửi lời cám ơn đến Quý Thầy cô Khoa Công nghệ Hóa học đã tạo điều kiện để em được
học tập và trau dồi những kiến thức nền tảng cơ bản, rèn luyện những thao tác thực nghiệm
qua các buổi học thực hành để nâng cao kỹ năng chuyên môn. Em hi vọng với những gì đã
được học, được đón nhận từ Quý Thầy cô sẽ giúp những sinh viên như em đây đem ra áp
dụng trong nhu cầu công việc sau này.
Đặc biệt, em xin bày tỏ lòng biết ơn sâu sắc nhất đến giảng viên hướng dẫn TS. Trần
Thị Thanh Nhã, mặc dù công việc bận rộn khiến cô phải lo lắng nhưng cô vẫn luôn dành
thời gian để quan tâm giúp đỡ, hướng dẫn, định hướng cho những nghiên cứu của em. Cô
luôn kịp thời hỗ trợ và đồng hành trước những khó khăn trong quá trình thực hiện đề tài để
em hoàn thành đồ án một cách tốt nhất.
Sau cùng em xin dành lời cám ơn này đến cha mẹ. Cảm ơn cha mẹ đã cho con một
hình hài nguyên vẹn và nuôi nấng con nên người. Để con được bước vào cánh cổng Đại học
này chắc hẳn cha mẹ đã phải hy sinh và vất vả rất nhiều. Những năm tháng trưởng thành
cùng với những bài học vấp ngã đầu đời thôi thúc con phải cố gắng nhiều hơn nữa. Con cảm
ơn cha mẹ thật nhiều! Cảm ơn bạn bè đã luôn đồng hành và sẻ chia cùng tôi trong suốt quãng
thời gian qua, cùng tôi viết lên những kỉ niệm tươi đẹp nhất. Chúc các bạn đạt được những
ước mơ và dự định trong tương lai!
Với những hạn chế trong thời gian và điều kiện nghiên cứu, đồng thời dưới góc nhìn
của một sinh viên nên chưa thể bao quát toàn bộ kiến thức và không thể tránh khỏi những
sai sót, em rất mong nhận được những đóng góp và ý kiến của Quý Thầy cô để đề tài của em
được hoàn thiện tốt hơn.
Em xin chân thành cám ơn!
TP. Hồ Chí Minh, ngày 08 tháng 07 năm 2022
Sinh viên thực hiện
Nguyễn Thị Minh Anh
NHẬN XÉT CỦA GIẢNG VIÊN HƯỚNG DẪN
.................................................................................................................................................
.................................................................................................................................................
.................................................................................................................................................
.................................................................................................................................................
.................................................................................................................................................
.................................................................................................................................................
.................................................................................................................................................
.................................................................................................................................................
.................................................................................................................................................
.................................................................................................................................................
.................................................................................................................................................
Phần đánh giá: (thang điểm 10)
• Thái độ thực hiện:
• Nội dung thực hiện:
• Kỹ năng trình bày:
• Tổng hợp kết quả:
Điểm bằng số: ………. Điểm bằng chữ: …………………………………………………….
TP. Hồ Chí Minh, ngày……. Tháng ……..năm 20….
Trưởng bộ môn Giảng viên hướng dẫn
Chuyên ngành (Ký ghi họ và tên)
NHẬN XÉT CỦA GIẢNG VIÊN PHẢN BIỆN
.................................................................................................................................................
.................................................................................................................................................
.................................................................................................................................................
.................................................................................................................................................
.................................................................................................................................................
.................................................................................................................................................
.................................................................................................................................................
.................................................................................................................................................
.................................................................................................................................................
.................................................................................................................................................
.................................................................................................................................................
TP. Hồ Chí Minh, ngày … tháng … năm 20…
Giảng viên phản biện
(Ký ghi họ và tên)
MỤC LỤC
LỜI NÓI ĐẦU......................................................................................................................1
CHƯƠNG 1: TỔNG QUAN ...............................................................................................3
1.1 Amino acid ..................................................................................................................3
1.1.1 Khái niệm .............................................................................................................3
1.1.2 Phân loại...............................................................................................................3
1.1.3 Thuộc tính hóa học ..............................................................................................4
1.2 Peptide.........................................................................................................................4
1.2.1 Khái niệm .............................................................................................................4
1.2.2 Cấu trúc................................................................................................................5
1.2.3 Phân loại...............................................................................................................6
1.2.4 Danh pháp ............................................................................................................6
1.2.5 Hoạt tính sinh học của peptide ...........................................................................6
1.2.6 Ứng dụng của peptide .........................................................................................7
1.3 Protein .........................................................................................................................8
1.3.1 Khái niệm .............................................................................................................8
1.3.2 Phân loại...............................................................................................................8
1.4 Gốc tự do.....................................................................................................................9
1.4.1 Khái niệm .............................................................................................................9
1.4.2 Nguyên nhân hình thành gốc tự do....................................................................9
1.4.3 Cơ chế hình thành gốc tự do.............................................................................10
1.4.4 Tác động của gốc tự do đến cơ thể con người.................................................10
1.5 Chất chống oxy hóa..................................................................................................11
1.5.1 Khái niệm ...........................................................................................................11
1.5.2 Phân loại.............................................................................................................11
1.5.3 Cơ chế hoạt động ...............................................................................................11
1.5.4 Hoạt tính chống oxy hóa của các peptide ........................................................12
1.6 Glutathione (GSH) và khả năng chống oxy hóa tương đương trolox TEAC .....12
1.6.1 Glutathione GSH ...............................................................................................12
1.6.2 Khả năng chống oxy hóa tương đương trolox TEAC ....................................13