Sử dụng công cụ tin sinh học (Bioinformatics) để dự đoán các Gen đích của Microrna 144 trong thoái hóa khớp

1

BỘ GIÁO DỤC VÀ ĐÀO TẠO

TRƢỜNG ĐẠI HỌC MỞ THÀNH PHỐ HỒ CHÍ MINH

BÁO CÁO TỔNG KẾT

ĐỀ TÀI NGHIÊN CỨU KHOA HỌC SINH VIÊN

SỬ DỤNG CÔNG CỤ TIN SINH HỌC

(BIOINFORMATICS) ĐỂ DỰ ĐOÁN CÁC GEN ĐÍCH

CỦA MICRORNA 144 TRONG THOÁI HÓA KHỚP

(MÃ SỐ ĐỀ TÀI: 23 )

THÀNH PHỐ HỒ CHÍ MINH , THÁNG 4 /2018

2

BỘ GIÁO DỤC VÀ ĐÀO TẠO

TRƢỜNG ĐẠI HỌC MỞ THÀNH PHỐ HỒ CHÍ MINH

BÁO CÁO TỔNG KẾT

ĐỀ TÀI NGHIÊN CỨU KHOA HỌC SINH VIÊN

SỬ DỤNG CÔNG CỤ TIN SINH HỌC

(BIOINFORMATICS) ĐỂ DỰ ĐOÁN CÁC GEN ĐÍCH

CỦA MICRORNA 144 TRONG THOÁI HÓA KHỚP

(MÃ SỐ ĐỀ TÀI: 23 )

Chủ nhiệm đề tài: Viên Ngọc Thạch

Khoa: Công nghệ Sinh học

Các Thành viên: Viên Ngọc Thạch

Lƣơng Hiếu Ngân

Ngƣời hƣớng dẫn: TS. Lê Thị Trúc Linh

CN. Hồ Thị Bích Phƣợng

THÀNH PHỐ HỒ CHÍ MINH, THÁNG 4/2018

3

MỤC LỤC

DANH MỤC TỪ VIẾT TẮT ............................................................................................... 4

ĐẶT VẤN ĐỀ ...................................................................................................................... 5

PHẦN I: ................................................................................................................................ 7

MỞ ĐẦU............................................................................................................................... 7

I.1) Tổng quan về thoái hóa khớp I.1.1) Tình hình hoái hóa khớp trên thế giới và

Việt Nam........................................................................................................................ 8

I.1.2) Nguyên nhân và nguy cơ dẫn đến bệnh THK.................................................... 10

I.1.3) Các dạng THK.................................................................................................... 12

a.Thoái hóa khớp gối: .................................................................................................. 12

b.Thoái hóa khớp háng................................................................................................. 12

I.2) MicroRNA 144 ......................................................................................................... 16

I.2.1) Tổng quan về microRNA................................................................................... 16

I.2.2) Tổng quan về microRNA 144............................................................................ 17

I.3) Mục tiêu của đề tài.................................................................................................... 18

PHẦN II :............................................................................................................................ 19

VẬT LIỆU VÀ PHƢƠNG PHÁP NGHIÊN CỨU........................................................... 19

PHẦN III:............................................................................................................................ 21

KẾT QUẢ VÀ BIỆN LUẬN.............................................................................................. 21

III.1) Các gen đích của miR-144..................................................................................... 22

III.1.1) Xác định trình tự của miR-144 trƣởng thành.................................................. 22

III.2. Các gen đích tiềm năng của miR-144 trong THK................................................. 28

III.3. Vị trí gắn trình tự “seed site” của miR-144 trên vùng 3’UTR và 2kb up-stream

của một số gen đích tiềm năng trong THK..................................................................... 29

PHẦN IV: ........................................................................................................................... 31

KẾT LUẬN VÀ KIẾN NGHỊ............................................................................................ 31

IV.1) Kết luận.................................................................................................................. 32

IV.2.) Kiến nghị............................................................................................................... 32

TÀI LIỆU THAM KHẢO .................................................................................................. 33

PHỤ LỤC............................................................................................................................ 37

4

DANH MỤC TỪ VIẾT TẮT

1. OA : OSTEOATHRITIS

2. THK: THOÁI HÓA KHỚP

3. MiR- 144 : Micro RNA 144

5

ĐẶT VẤN ĐỀ