Khảo sát tính chất methyl hóa bất thường trên gen E-Cadherin và APC đối với bệnh ung thư vú và ung thư vòm họng

BỘ GIÁO DỤC VÀ ĐÀO TẠO

TRƯỜNG ĐẠI HỌC MỞ THÀNH PHỐ HỒ CHÍ MINH

BÁO CÁO TỔNG KẾT

ĐỀ TÀI NGHIÊN CỨU KHOA HỌC SINH VIÊN

KHẢO SÁT TÍNH CHẤT METHYL HÓA BẤT THƯỜNG TRÊN GEN

E-CADHERIN VÀ APC ĐỐI VỚI BỆNH UNG THƯ VÚ VÀ UNG THƯ

VÒM HỌNG: META-ANALYSIS & IN SILICO

Bình Dương, tháng 3 năm 2019

BỘ GIÁO DỤC VÀ ĐÀO TẠO

TRƯỜNG ĐẠI HỌC MỞ THÀNH PHỐ HỒ CHÍ MINH

BÁO CÁO TỔNG KẾT

ĐỀ TÀI NGHIÊN CỨU KHOA HỌC SINH VIÊN

KHẢO SÁT TÍNH CHẤT METHYL HÓA BẤT THƯỜNG TRÊN GEN

E-CADHERIN VÀ APC ĐỐI VỚI BỆNH UNG THƯ VÚ VÀ UNG THƯ

VÒM HỌNG: META-ANALYSIS & IN SILICO

Chủ nhiệm đề tài: Nguyễn Thị Hoàng Trinh

Khoa: Công Nghệ Sinh Học

Các thành viên: Nguyễn Thị Phương Diệu

Phạm Thị Mộng Tuyền

Mai Kim Bảo Châu

Nguyễn Thị Lệ

Người hướng dẫn: Th.S Trương Kim Phượng

Bình Dương, tháng 3 năm 2019

BỘ GIÁO DỤC VÀ ĐÀO TẠO

TRƯỜNG ĐẠI HỌC MỞ

THÀNH PHỐ HỒ CHÍ MINH

CỘNG HOÀ XÃ HỘI CHỦ NGHĨA VIỆT NAM

Độc lập - Tự do - Hạnh phúc

THÔNG TIN KẾT QUẢ NGHIÊN CỨU CỦA ĐỀ TÀI

1. Thông tin chung:

- Tên đề tài: Khảo sát tính chất methyl hóa bất thường trên gen E-cadherin và

APC đối với bệnh ung thư vú và ung thư vòm họng: Meta-analysis & In silico

- Sinh viên thực hiện: Nguyễn Thị Hoàng Trinh

- Lớp: YD51 Khoa: Công Nghệ Sinh Học Năm thứ: 4 Số năm đào tạo: 4

- Người hướng dẫn: ThS. Trương Kim Phượng

2. Mục tiêu đề tài:

Xác định sự tương quan giữa tính chất methyl hóa bất thường (vượt mức) trên vùng

promoter gen E-cadherin và APC đối với bệnh ung thư vú và ung thư vòm họng trên

thế giới và Việt Nam.

3. Tính mới và sáng tạo:

Áp dụng các công cụ tin sinh học và công cụ thống kê, kết quả nghiên cứu bộc lộ sự

tương quan giữa tính chất methyl hóa bất thường (vượt mức) trên vùng promoter gen

E-cadherin và APC và nguy cơ/khả năng mắc bệnh ung thư vú và ung thư vòm họng

trên thế giới. Kết quả nghiên cứu bước đầu biểu thị tính tiềm năng của dấu chứng sinh

học: tính chất methyl hóa bất thường (vượt mức) trên vùng promoter gen E-cadherin

và APC trong việc tiên lượng, chẩn đoán các bệnh lý ung thư.

4. Kết quả nghiên cứu:

Trong nội dung phân tích tổng hợp, nhóm nghiên cứu thu thập được các bộ dữ liệu khoa

học phù hợp để xác định chỉ số OR biểu thị độ chênh về sự xuất hiện tính chất methyl

hóa gen CDH1 trên bộ mẫu bệnh ung thư vòm họng và ung thư vú so với bộ mẫu lành

lần lượt là OR = 12,386 (95%CI = 7,499-20,458; P< 0,001), OR = 4,018 (95%CI =

1,272-12,685; P = 0,018). Kết quả nghiên cứu phản ánh sự tương quan chặt giữa tính

chất methyl hóa gen CDH1 và bệnh ung thư vòm họng, so với bệnh ung thư vú.

Bên cạnh đó, chỉ số OR biểu thị độ chênh về sự xuất hiện tính chất methyl hóa gen APC

trên bộ mẫu bệnh ung thư vòm họng và ung thư vú so với bộ mẫu lành lần lượt là OR =

2,545 (95%CI = 53,65-94,78; p = 0,0016), OR = 14,842 (95%CI = 3,830-57,504; P<

0,001). Kết quả nghiên cứu phản ánh sự tương quan chặt giữa tính chất methyl hóa trên

gen APC và bệnh ung thư vú, so với sự tương quan với bệnh ung thư vòm họng.

Trong nội dung khảo sát trên máy tính (In silico), nhóm nghiên cứu thu thập và chọn

lọc các bộ mồi thuộc phương pháp MSP: (1) Bộ mồi CDH1_MF&CDH1_MR,

CDH1_UF& CDH1_UR khuếch đại đặc hiệu trạng thái allen có hoặc không bị methyl

hóa vùng trình tự promoter gen CDH1, tại đảo CpG thứ I. Chiều dài sản phẩm MSP

gồm có 205 bp và 212 bp; (2) Bộ mồi APC_MF& APC_MR, APC_UF& APC_UR

khuếch đại đặc hiệu trạng thái allen có hoặc không bị methyl hóa của vùng trình tự

promoter gen APC. Chiều dài sản phẩm MSP gồm có 98bp và 108 bp.

5. Đóng góp về mặt kinh tế - xã hội, giáo dục và đào tạo, an ninh, quốc phòng và

khả năng áp dụng của đề tài:

Kết quả nghiên cứu phần nào bộc lộ đặc điểm tính chất methyl hóa bất thường trên vùng

gen mục tiêu: CDH1 và APC trên bộ mẫu ung thư vòm họng và ung thư vú, tạo nên tiền

đề phát triển hướng nghiên cứu về dấu chứng sinh học trong tiên lượng, chẩn đoán bệnh

ung thư vòm họng và ung thư vú.

6. Công bố khoa học của sinh viên từ kết quả nghiên cứu của đề tài (ghi rõ tên tạp

chí nếu có) hoặc nhận xét, đánh giá của cơ sở đã áp dụng các kết quả nghiên cứu (nếu

có) :

Ngày tháng năm...

Sinh viên chịu trách nhiệm chính

thực hiện đề tài

(ký, họ và tên)

Nhận xét của người hướng dẫn về những đóng góp khoa học của sinh viên thực

hiện đề tài (phần này do người hướng dẫn ghi) :

Nhóm sinh viên đã nỗ lực để thu thập, khai thác dữ liệu trên nguồn công bố khoa học

tiếng Anh để thực hiện các nội dung nghiên cứu theo dạng phân tích tổng hợp – đòi hỏi

khả năng đọc-hiểu dữ liệu và trích xuất và thực hiện đúng các nguyên tắc trong nghiên

cứu thực chứng, liên quan đến lĩnh vực y sinh học. Công trình nghiên cứu phản ánh một

số khía cạnh của tính chất methyl hóa gen CDH1 và APC trên bệnh ung thư vòm họng và

ung thư vú.

Ngày tháng năm

Xác nhận của đơn vị

(ký tên và đóng dấu)

Người hướng dẫn

(ký, họ và tên)

BỘ GIÁO DỤC VÀ ĐÀO TẠO

TRƯỜNG ĐẠI HỌC MỞ

THÀNH PHỐ HỒ CHÍ MINH

CỘNG HOÀ XÃ HỘI CHỦ NGHĨA VIỆT

NAM

Độc lập - Tự do - Hạnh phúc

THÔNG TIN VỀ SINH VIÊN

CHỊU TRÁCH NHIỆM CHÍNH THỰC HIỆN ĐỀ TÀI

I. SƠ LƯỢC VỀ SINH VIÊN:

Họ và tên: Nguyễn Thị Hoàng Trinh

Sinh ngày: 21 tháng 10 năm 1997

Nơi sinh: Đà Lạt, Lâm Đồng

Lớp: YD51 Khóa: 2015

Khoa: Công Nghệ Sinh Học

Địa chỉ liên hệ: Tự Phước, Phường 11, Thành Phố Đà Lạt, Tỉnh Lâm Đồng

Điện thoại: 0911667833 Email: [email protected]

II. QUÁ TRÌNH HỌC TẬP (kê khai thành tích của sinh viên từ năm thứ 1 đến năm

đang học) :

* Năm thứ 1:

Ngành học: Công Nghệ Sinh Học Khoa: Công Nghệ Sinh Học

Kết quả xếp loại học tập: Trung bình-Khá

Sơ lược thành tích: 6.7

* Năm thứ 2:

Ngành học: Công Nghệ Sinh Học Khoa:Công Nghệ Sinh Học

Kết quả xếp loại học tập: Trung bình-Khá

Sơ lược thành tích: 6.44

*Năm thứ 3:

Ngành học: Công Nghệ Sinh Học Khoa:Công Nghệ Sinh Học

Kết quả xếp loại học tập: Trung Bình-Khá

Sơ lược thành tích: 6.76

Ảnh 4x6