Đa dạng di truyền 5 quần thể gà nội

Đa dạng di truyền 5 quần thể gà nội

Lê Quang Nam

Trường Đại học Khoa học Tự nhiên

Luận văn ThS chuyên ngành: Sinh học thực nghiệm; Mã số: 60 42 30

Người hướng dẫn: PGS.TS Nguyễn Văn Mùi

Năm bảo vệ: 2012

Abstract: Nghiên cứu nguồn gốc và phân loại gà nhà; các kỹ thuật sinh học phân tử

được sử dụng trong nghiên cứu đa dạng di truyền 5 quần thể gà nội; các đặc điểm di

truyền quần thể. Nghiên cứu 60 cá thể gà Trới và 59 cá thể Tiên Yên; 54 cá thể gà

Móng … ở Hà Nam, Hà Nội và Thái Bình; các kỹ thuật thực nghiệm; phân tích thống

kê. Trình bày kết quả tách AND và phân tích đoạn; kết quả đánh giá đặc điểm di

truyền.

Keywords: Sinh học thực nghiệm; Đa dạng di truyền; Gà

Content

Chƣơng 1 - TỔNG QUAN TÀI LIỆU

1.1 Nguồn gốc và phân loại gà nhà

Các giống gà đã được con người thuần hóa từ gà rừng hơn 2000 năm trước [11]. Gà

bản địa có một tiềm năng di truyền phong phú biểu hiện qua kiểu hình: hình dạng, màu sắc

lông, dạng mào, dái tai, dạng đuôi, kết cấu giữa cổ-ngực [2]. Những giống gà Á Đông, Đông

Nam Á như gà Brahman, gà Cochinchine, gà chọi… đã tham gia vào việc hình thành các

giống gà công nghiệp hiện nay [2].

1.2 Các kỹ thuật sinh học phân tử đƣợc sử dụng trong nghiên cứu

1.2.1 PCR

PCR là một phương pháp mang tính cách mạng được phát triển bởi Kary Mullis trong

những năm 80. Phản ứng PCR chỉ đòi hỏi một lượng ADN làm khuôn ban đầu rất nhỏ. Trong

- 2 -

trường hợp ADN genome động vật có vú, 1.0 μg ADN là tối ưu cho mỗi phản ứng, có chứa

xấp xỉ 3x105

bản sao của một gen trên NST. Đối với nấm men, vi khuẩn và plasmid, lượng

ADN tối ưu được sử dụng cho mỗi phản ứng tương ứng là 10 ng, 1 ng và 1 pg [35].

1.2.2 Kỹ thuật microsatellite

Microsatellite là loại ADN lặp đi lặp lại được tạo thành từ các đoạn lặp dài từ 2 đến 8

nucleotide1

. Chúng có thể có độ đa hình cao và thường là các chỉ thị phân tử trong nghiên cứu

di truyền quần thể. Các microsatellite có thể tìm thấy mọi nơi trong hệ gen, cả vùng mã hoá và

không mã hoá [41]. Các microsatellite được sử dụng để lập bản đồ và nghiên cứu đa dạng di

truyền trên gà ngay từ thời điểm nó được ứng dụng là do trình tự của chúng có độ đa hình cao,

phân bố rải rác toàn bộ hệ gen [37], và rất nhiều locus microsatellite nghiên cứu trên gà đã

được công bố và lập bản đồ [12], [21]. Thông tin về các microsatellite gà có thể dễ dàng nhận

được qua các trang web như http://www.thearkdb.org/arkdb/,

http://aviandiv.tzv.fal.de/primer_table.html ...

1.2.3 Một số nghiên cứu sử dụng kỹ thuật microsatellite

Microsatellite được Tổ chức Nông Lương Liên Hợp Quốc - FAO dùng làm công cụ

phân tử đầu tiên cho dự án MoDAD (Measurement of Domestic Animal Diversity) nhằm đánh

giá sự đa dạng di truyền của động vật bản địa. Hiện nay các microsatellite là công cụ tốt nhất

cho việc nghiên cứu các locus liên quan đến tính trạng số lượng và cho việc đánh giá sự đa

dạng di truyền của các quần thể vật nuôi.

Kết quả nghiên cứu các giống gà nội địa Trung Quốc cho thấy khi phân tích bằng

microsatellite thì tần số dị hợp tử quan sát được là cao nhất (75.91%), tiếp theo là phương

pháp RAPD (Random Amplification of Polymorphic DNA) (26.32%), cuối cùng là phương

pháp phân tích allozyme (22.09%) [44]. Dùng microsatellite khi nghiên cứu trên quần thể gà

có thể thu được hơn 12 alen trên một locus và tần số dị hợp tử có thể lên đến 90% [40]. Khi sử

dụng 14 locus microsatellite để phân tích mối quan hệ di truyền giữa các quần thể gà bản địa

khác nhau (chủ yếu từ Đức và Ucraina với tổng số 224 cá thể của 20 quần thể) và với gà rừng,

việc lập cây quan hệ di truyền đã được tiến hành và thu được 3 nhóm chính [32]. 42 chỉ thị

microsatellite đã được sử dụng để phân tích 23 dòng gà cao sản của các giống gà Leghorn, gà

1

http://www.nature.com/nrg/journal/v5/n1/glossary/nrg1247_glossary.html