So sánh trình tự gen DREB1 liên quan đến khả năng chịu hạn của một số giống đậu tương ở miền núi phía Bắc Việt Nam

Số hóa bởi Trung tâm Học liệu – Đại học Thái Nguyên http://www.lrc-tnu.edu.vn

ĐẠI HỌC THÁI NGUYÊN

TRƯỜNG ĐẠI HỌC KHOA HỌC

PHẠM MINH DUY

SO SÁNH TRÌNH TỰ GEN DREB1 LIÊN QUAN ĐẾN

KHẢ NĂNG CHỊU HẠN CỦA MỘT SỐ GIỐNG ĐẬU

TƯƠNG Ở MIỀN NÚI PHÍA BẮC VIỆT NAM

LUẬN VĂN THẠC SĨ CÔNG NGHỆ SINH HỌC

Thái Nguyên - 2011

Số hóa bởi Trung tâm Học liệu – Đại học Thái Nguyên http://www.lrc-tnu.edu.vn

LỜI CAM ĐOAN

ĐẠI HỌC THÁI NGUYÊN

TRƯỜNG ĐẠI HỌC KHOA HỌC

PHẠM MINH DUY

SO SÁNH TRÌNH TỰ GEN DREB1 LIÊN QUAN ĐẾN

KHẢ NĂNG CHỊU HẠN CỦA MỘT SỐ GIỐNG ĐẬU

TƯƠNG Ở MIỀN NÚI PHÍA BẮC VIỆT NAM

Chuyên ngành: CÔNG NGHỆ SINH HỌC

Mã số: 60 42 80

LUẬN VĂN THẠC SĨ CÔNG NGHỆ SINH HỌC

Người hướng dẫn khoa học: TS. NGUYỄN VŨ THANH THANH

Thái Nguyên - 2011

Số hóa bởi Trung tâm Học liệu – Đại học Thái Nguyên http://www.lrc-tnu.edu.vn

LỜI CAM ĐOAN

Tôi xin cam đoan đây là công trình nghiên cứu do chính tôi thực hiện. Các số

liệu, kết quả nêu trong luận văn là trung thực và chưa từng ai công bố trong

bất kỳ công trình nào khác.

Thái Nguyên, ngày tháng năm 2011

Tác giả

Phạm Minh Duy

Số hóa bởi Trung tâm Học liệu – Đại học Thái Nguyên http://www.lrc-tnu.edu.vn

LỜI CẢM ƠN

Tôi xin bày tỏ lòng biết ơn sâu sắc tới TS. Nguyễn Vũ Thanh Thanh -

Trường Đại học Khoa học – Đại học Thái Nguyên đã tận tình hướng dẫn, chỉ

bảo và tạo mọi điều kiện giúp đỡ tôi hoàn thành luận văn này.

Tôi cũng xin chân thành cảm ơn các kỹ thuật viên Bộ môn Sinh học

phân tử và Công nghệ gen - Viện Khoa học sự sống – Đại học Thái Nguyên.

Tôi xin bày tỏ lòng cảm ơn đến gia đình, bạn bè đã động viên khuyến

khích và giúp đỡ tôi trong suốt quá trình học tập và làm luận văn.

Công trình được thực hiện với sự tài trợ kinh phí của dự án TRIG. Tôi

xin chân thành cảm ơn sự giúp đỡ quý báu đó

Tác giả luận văn

Phạm Minh Duy

Số hóa bởi Trung tâm Học liệu – Đại học Thái Nguyên http://www.lrc-tnu.edu.vn

NHỮNG CHỮ VIẾT TẮT

ABA Abscisic Acid (Axit abxisic)

DNA Axit deoxyribonucleic (Deoxyribonucleic acid)

ASTT Áp suất thẩm thấu

bp Base pair (Cặp base)

CTAB Cetyltrimethyl – amonium bromide

DREB Dehydration- Responsive Element Binding

cs Cộng sự

HSP Heat shock protein (Protein sốc nhiệt)

LEA

Late embryogenesis abundant protein (Protein tích lũy với số

lượ ng lớn ở giai đoạn cuối củ a quá trình hình thành phôi)

LTP Lipid transfer protein (Protein vận chuyển lipid)

MGPT Môi giới phân tử (Molecular chaperone)

PCR Polymerase Chain Reaction (Phản ứng chuỗi polymerase)

TAE Tris Acetate EDTA

Số hóa bởi Trung tâm Học liệu – Đại học Thái Nguyên http://www.lrc-tnu.edu.vn

DANH MỤ C CÁ C BẢNG

Bảng Tên các bảng trong luận văn Trang

1.1 Diện tích và sản lượng đậu tương của một số quốc gia

trên thế giới 5

1.2 Năng suất đậu tương ở một số quốc gia trên thế giới 8

1.3 Mộ t số trình tự genDREB1 đã đăng ký rtên Ngân hàng gen

(NCBI) 24

2.1 Tên và nguồn gốc các giống đậu tương nghiên cứu 25

2.2 Danh mụ c các thiết bị sử dụ ng 27

2.3 Mồi nhân gen DREB1 29

2.4 Thành phần phản ứng nhân gen DREB1 29

2.5 Thành phần phản ứng gắn gen vào vector 31

2.6 Thành phần phản ứng cắt plasmid tái tổ hợp 32

3.1 Phổ hấp thụ DNA ở bước sóng 260nm và 280nm của

giống đậu tương VNS, CPB, CYS 35

3.2 Vị trí khác biệt về trình tự nucleotide của gen DREB1 ở CYS,

CPB và VNS 40

3.3 Vị trí sai khác trong trình tự amino acid của protein

DREB1 giữa hai nhóm chịu hạn khác nhau 42

3.4

So sánh mức độ tương đồng trình tự nucleotide củ a gen

DREB1 ở giống đậu tương CYS, CPB và VNS với

FR822736

43

3.5

Hệ số tương đồng về amino acid trong protein DREB1

của CPB, CYS, VNS, FJ965342, AY802779 và

FR822736

45