Nghiên Cứu Xác Định Đoạn Adn Mã Vạch Cho Loài Gõ Đỏ Afzelia Xylocarpa Kurz Craib Xuất Xứ Lào

TRƢỜNG ĐẠI HỌC LÂM NGHIỆP

VIỆN CÔNG NGHỆ SINH HỌC

----------o0o----------

KHÓA LUẬN TỐT NGHIỆP

NGHIÊN CỨU XÁC ĐỊNH ĐOẠN ADN MÃ VẠCH CHO LOÀI GÕ ĐỎ

(Afzelia Xylocarpa (Kurz) Craib) XUẤT XỨ LÀO

NGÀNH: CÔNG NGHỆ SINH HỌC

MÃ NGÀNH: 7420201

Giáo viên hướng dẫn : PGS. TS. Nguyễn Văn Việt

ThS. Nguyễn Thị Huyền

Sinh viên thực hiện : Lê Thị Loan

Mã sinh viên : 1453071818

Lớp : K59B – CNSH

Khóa : 2014 - 2018

Hà Nội, 2018

LỜI CẢM ƠN

Trong suốt quá trình học tập tại trường Đại học Lâm nghiệp Việt Nam

em đã nhận được rất nhiều sự quan tâm và chỉ bảo tận tình của các thầy cô, đặc

biệt là các thầy cô giáo trong Viện Công nghệ sinh học Lâm nghiệp.

Em xin gửi lời cảm ơn chân thành tới PGS.TS. Nguyễn Văn Việt và

ThS. Nguyễn Thị Huyền Bộ môn Công nghệ tế bào, Viện Công nghệ sinh học

Lâm nghiệp, là người đã hướng dẫn trực tiếp em thực hiện khóa luận tốt nghiệp

này.

Em cũng xin cảm ơn tới toàn thể các cán bộ Viện Công nghệ sinh học

Lâm nghiệp, Trường Đại học Lâm nghiệp Việt Nam đã tạo điều kiện thuận lợi

để em có thể hoàn thành bài luận văn một cách tốt nhất.

Cuối cùng em xin chân thành cảm ơn tới gia đình và bạn bè đã luôn ủng

hộ, động viên và giúp đỡ em trong suốt quá trình thực hiện đề tài.

Do thời gian có hạn nên bài làm khó tránh khỏi những thiếu sót, em rất

mong nhận được những ý kiến đóng góp của thầy cô và bạn bè để bài làm được

hoàn thiện hơn.

Em xin chân thành cảm ơn!

Hà nội, ngày 14 tháng 5 năm 2018

Sinh viên

Lê Thị Loan

MỤC LỤC

LỜI CẢM ƠN

MỤC LỤC

DANH MỤC BẢNG

DANH MỤC HÌNH

DANH MỤC CÁC TỪ VIẾT TẮT

ĐẶT VẤN ĐỀ ................................................................................................................ 1

CHƢƠNG 1: TỔNG QUAN TÀI LIỆU................................................................. 2

1.1. Tổng quan về cây Gõ đỏ .............................................................................. 2

1.1.1. Giới thiệu về Gõ đỏ ................................................................................... 2

1.1.2. Đặc điểm về hình thái ............................................................................... 2

1.1.3. Đặc điểm về sinh thái và phân bố............................................................. 3

1.1.4. Giá trị của Gõ đỏ ...................................................................................... 4

1.1.5. Tình trạng.................................................................................................. 5

1.2. Tổng quan về ADN mã vạch........................................................................ 5

1.2.1. ADN mã vạch (DNA barcode). ................................................................ 5

1.2.2. Ứng dụng và những lợi ích của mã vạch ADN......................................... 6

1.2.3. Các đặc điểm cơ bản của trình tự mã vạch ............................................. 9

1.3. Một số mã vạch ADN ở thực vật được sử dụng phổ biến và tình hình

nghiên cứu ........................................................................................................... 9

1.3.1. Mã vạch ở thực vật.................................................................................... 9

1.3.2. Hiện trạng của các mã vạch ở thực vật................................................. 15

1.4. Những nghiên cứu về ứng dụng ADN mã vạch trong giám định loài. ...... 17

1.4.1. Trên thế giới............................................................................................ 17

1.4.2. Ở Việt Nam ............................................................................................. 19

CHƢƠNG 2. MỤC TIÊU, NỘI DUNG, VẬT LIỆU VÀ PHƢƠNG PHÁP

NGHIÊN CỨU............................................................................................................. 22

2.1. Mục tiêu nghiên cứu................................................................................... 22

2.2. Nội dung nghiên cứu.................................................................................. 22

2.3. Phạm vi và địa điểm nghiên cứu................................................................ 22

2.4. Vật liệu, hóa chất, và các thiết bị sử dụng trong nghiên cứu..................... 22

2.4.1. Vật liệu nghiên cứu ................................................................................. 22

2.4.2. Hóa chất .................................................................................................. 23

2.4.3. Các thiết bị dùng trong nghiên cứu ........................................................ 23

2.5. Phương pháp nghiên cứu............................................................................ 24

2.5.1. Phương pháp tách chiết ADN tổng số..................................................... 24

2.5.2. Phương pháp PCR với mồi đặc hiệu....................................................... 25

2.5.3. Phương pháp điện di............................................................................... 26

2.5.4. Phương pháp tinh sạch sản phẩm PCR và giải trình tự......................... 27

CHƢƠNG 3. KẾT QUẢ NGHIÊN CỨU............................................................. 28

3.1. Kết quả tách ADN tổng số ......................................................................... 28

3.2. Kết quả PCR nhân gen với mồi đặc hiệu ................................................... 28

3.2.1. Kết quả nhân bản gen trnL với cặp mồi đặc hiệu................................... 29

3.2.2. Kết quả nhân bản gen rbcL với cặp mồi đặc hiệu .................................. 30

3.2.3. Kết quả nhân bản gen psbA-trnH với cặp mồi đặc hiệu......................... 30

3.2.4. Kết quả nhân bản gen matK với cặp mồi đặc hiệu................................. 31

3.3. Kết quả phân tích trình tự nucleotide của đoạn gen matK......................... 31

3.4. Xây dựng cây phát sinh chủng loại............................................................ 33

KẾT LUẬN VÀ KIẾN NGHỊ................................................................................. 35

1. Kết luận ........................................................................................................ 35

2. Kiến nghị ...................................................................................................... 35

TÀI LIỆU THAM KHẢO