Nghiên Cứu Xác Định Các Đoạn Dna Barcode Cho Loài Áo Cộc Lirodendron Chinense Phục Vụ Giám Định Loài

TRƯỜNG ĐẠI HỌC LÂM NGHIỆP VIỆT NAM

VIỆN CÔNG NGHỆ SINH HỌC LÂM NGHIỆP

----------o0o----------

KHÓA LUẬN TỐT NGHIỆP

NGHIÊN CỨU XÁC ĐỊNH CÁC ĐOẠN DNA BARCODE

CHO LOÀI ÁO CỘC (LIRIODENDRON CHINENSE) PHỤC

VỤ GIÁM ĐỊNH LOÀI

NGÀNH : CÔNG NGHỆ SINH HỌC

MÃ SỐ : 7420201

Giáo viên hướng dẫn : TS. Bùi Thị Mai Hương

Sinh viên thực hiện : Trần Phương Thảo

Lớp : K61 – CNSH

Khóa học : 2016 - 2020

Hà Nội, 2020

1

LỜI CẢM ƠN

Để hoàn thành được khóa luận này, với lòng biết ơn sâu sắc nhất, tôi xin chân

thành cảm ơn quý thầy cô Viện Công nghệ sinh học Lâm nghiệp - Trường Đại học

Lâm nghiệp đã giúp đỡ và chỉ bảo tận tình tôi trong suốt quá trình thực hiện khóa

luận tại trường, đặc biệt là sự giúp đỡ của các thầy cô bên bộ môn Công nghệ gen

và Di truyền phân tử của Viện Công nghệ sinh học Lâm nghiệp.

Tôi xin chân thành cảm ơn TS. Nguyễn Văn Phong, TS. Bùi Thị Mai Hương

đã tận tình giúp đỡ và chỉ bảo tôi trong quá trình hoàn thành khóa luận. Đặc biệt,

đề tài “Nghiên cứu xác định các đoạn DNA barcode cho Loài Áo cộc

(Liriodendron chinense) phục vụ giám định loài” do TS. Nguyễn Văn Phong làm

Chủ nhiệm. Với những kiến thức và kỹ năng thầy và cô truyền dạy không chỉ giúp

tôi hoàn thành khóa luận mà còn là tài sản quý báu theo giúp tôi sau này.

Cảm ơn các anh chị thuộc Viện Công nghệ sinh học đã quan tâm giúp đỡ tôi

trong suốt thời gian thực hiện khóa luận.

Chân thành cảm ơn gia đình và bạn bè luôn động viên và hỗ trợ tôi trong suốt

thời gian qua.

Mặc dù tôi đã cố gắng nhưng chắc chắn bài khóa luận vẫn không thể tránh

khỏi sai sót. Vì vậy, tôi rất mong nhận được những ý kiến đánh giá, góp ý để tạo

tiền đề vững chắc hơn cho tôi trong công việc sau này.

Xuân Mai, ngày … tháng … năm 2020

Sinh viên

Trần Phương Thảo

2

MỤC LỤC

LỜI CẢM ƠN ............................................................................................................1

MỤC LỤC..................................................................................................................2

DANH MỤC TỪ VIẾT TẮT ....................................................................................4

DANH MỤC HÌNH...................................................................................................7

DANH MỤC BẢNG..................................................................................................8

ĐẶT VẤN ĐỀ ...........................................................................................................9

CHƯƠNG I: TỔNG QUAN ĐỀ TÀI......................................................................11

1.1. Tổng quan về Áo cộc: ..............................................................................11

1.1.1. Phân loại khoa học:............................................................................11

1.1.2. Phân bố: .............................................................................................11

1.1.3. Đặc điểm sinh học:.............................................................................12

1.1.4. Giá trị sử dụng: ..................................................................................14

1.1.5. Một số đề tài nghiên cứu có liên quan đến loài cây Áo cộc đã trích

dẫn khi đánh giá tổng quan:.............................................................................14

1.2. Tổng quan về DNA barcode (DNA mã vạch): ........................................15

1.2.1. Giới thiệu về mã vạch DNA barcode: ...............................................15

1.2.2. Một số DNA barcode được sử dụng:.................................................17

1.2.3. Ứng dụng của DNA barcode trên thực vật:.......................................24

CHƯƠNG II: MỤC TIÊU, NỘI DUNG, VẬT LIỆU VÀ PHƯƠNG PHÁP

NGHIÊN CỨU.........................................................................................................26

2.1. Mục tiêu nghiên cứu: ....................................................................................26

2.2. Nội dung nghiên cứu:....................................................................................26

2.3. Vật liệu, hóa chất, các thiết bị sử dụng trong nghiên cứu: ...........................26

3

2.3.1. Vật liệu nghiên cứu:...............................................................................26

2.3.2. Hóa chất sử dụng: ..................................................................................26

2.3.3. Thiết bị sử dụng: ....................................................................................28

2.4. Phương pháp nghiên cứu: .............................................................................28

CHƯƠNG III: KẾT QUẢ NGHIÊN CỨU VÀ THẢO LUẬN ..............................35

3.1. Kết quả tách chiết DNA tổng số:..................................................................35

3.2. Kết quả nhân bản vùng gen nghiên cứu bằng kĩ thuật PCR:........................35

3.3. Phân tích kết quả:..........................................................................................36

3.3.1. Xác định và phân tích trình tự DNA trên các vùng gen nghiên cứu: ....36

3.3.2. So sánh khả năng phân biệt của các đoạn trình tự:................................49

CHƯƠNG IV: KẾT LUẬN VÀ KIẾN NGHỊ.........................................................51

4.1. Kết luận:........................................................................................................51

4.2. Kiến nghị:......................................................................................................51

TÀI LIỆU THAM KHẢO .......................................................................................52

4

DANH MỤC TỪ VIẾT TẮT

TT

Chữ

viết tắt

Nghĩa tiếng Anh Nghĩa tiếng Việt

1 ATP Adenosin triphosphat Adenosin triphosphat

2 BME β-mereaptoethanol β-mereaptoethanol

3 BOLD Barcode of Life data Barcode of Life data

4 Bp Base pair Cặp base

5 CBOL

Consortium for the Barcode

of Life

Consortium for the Barcode of

Life

6 CITES

Convention on International

Trade in Endangered Species

of Wild Fauna and Flora

Công ước về buôn bán quốc tế

các loài nguy cấp

7 cpDNA Chloroplast DNA Bộ gen lục lạp

8 CTAB

Cetyl trimethylammonium

bromide

Cetyl trimethylammonium

bromide

9 Cytb Cytochrome b Cytochrome b

10 DNA

(DNA)

Deoxyribonucleic acid Axit deoxyribonucleic

11 dNTP

Deoxyribonucleotide

triphosphate

Deoxyribonucleotid

triphosphate

12 EBA Extraction Buffer A Đệm tách A

13 EBB Extraction Buffer B Đệm tách B